經過五十年的發展，新華醫院已成為我國重要的醫療診治、醫學教育和醫學研究中心。

新華醫院包括新華院本部和分支醫療機構上海兒童醫學中心兩個臨床基地；建成小兒心血管病和小兒外科畸形兩個市級臨床醫學中心；設有上海市兒科醫學研究所、上海市小兒先天性心臟病研究所和上海市環境與兒童健康重點實驗室三所市級研究機構；擁有兒科醫學院、新華臨床醫學院和兒科繼續教育醫學院三個上海交通大學醫學院的分支醫學院；投資設立新華醫療開發公司和新華泛亞醫療投資管理有限公司等實業機構。

醫院現有核定床位數1728張(含分支機搆上海兒童醫學中心500張)，設有47個臨床科室，66個專業，8個校級研究室，心臟介入診療部、內窺鏡診治部、准分子鐳射診療部等6個醫療技術服務平臺，還設有WHO新生兒保健合作中心、衛生部遺傳醫學新生兒篩查及遺傳代謝病中心、上海市新生兒聽力障礙診治中心等，醫院年門急診總人次達220萬，出院病人總人次逾4萬，住院手術人次近235'。醫院的心血管內科、消化內科、神經內科、普外科、心胸外科、神經外科、泌尿外科、骨科、兒科學、兒外科學、眼科、耳鼻咽喉一頭頸外科、皮膚科、臨床營養科等學科綜合實力一流，分別為國家級、省部級、局級和醫院重點建設學科，共榮獲市校級臨床醫療成果獎21項。新華醫院在胃癌、慢性肝炎、肝纖維化診治、幹細胞移植、腹腔鏡、胸腔鏡、前列腺增生症電汽手術和腔內碎石等微創治療，居國內先進水準。心肌病防治、心律失常消融治療、冠狀動脈病變介入治療和微創搭橋手術，達國內一流水準。兒科學整體實力保持國內領先、國際先進水準，在心血管病介入治療、複雜先心病手術、外科畸形矯治、難治性白血病、新生兒疾病篩查、新生兒聽力障礙診治等為國內頂級水準。

眼科、皮膚科、耳鼻咽喉一頭頸外科、口腔科等專業各具特色。

作為上海交通大學醫學院的教學醫院，新華醫院通過學科建設，有效地搭建了提升教學科研水準的最佳平臺。目前，新華醫院在職職工近3000人，專業技術人員占職工總人數的83％，其中具有中高級職稱的占專業技術人員的46％。醫院現有博士生導師42名、碩士生導師181名，設有臨床博士後流動站，博士專業點8個，碩士專業點25個；先後培養了本科生5000余人、碩士300余  人、博土及博士後100令人。醫院科研成果疊出，近五年科研獎項包括有國家科技進步二等獎等30余項。另外，近五年來獲得專利授權20項；共發表論文1932篇，其中有96篇論文被SCI收錄， 25篇被ISTP收錄，8篇被曰收錄；撰寫專著5 7本；獲得國家、省部級等科研專案256項。此外，醫院和上海市兒科醫學研究所主辦的兒科專業學術期刊《臨床兒科雜誌》被多家國際檢索資料庫收錄。

近年來，新華醫院作為核心醫院與上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院、崇明堡鎮人民醫院共同組建了的新華醫院集團，吸納楊浦區中心醫院為分院，並與本市及外地的市區縣簽約支援29所社區衛生服務中心和郊區、農村的醫療機構。新華醫院占地面積逾200畝，綠化率達30％，總體建築面積180,000平方米。院本部設施一流的門診綜合樓、外科大樓、醫技樓和急診兒科門急診樓為病人提供了優美、舒適的就醫環境，建設中的醫療保健樓和科教樓將進一步為醫教研事業的騰飛提供保證。

今天的新華是一個開放的新華。自1979年起，醫院與美國、日本、加拿大、瑞典、法國、澳大利亞、荷蘭等國的醫療機構共建合作專案31個，並在世界健康基金會(ProjectHOPE)大力支持下建成了目前國內設備配置水準最高的上海兒童醫學中心。國際交流活動蓬勃開展，為新華醫院的發展增添了一份活力，也展示了中國醫院的良好形象。